GEM: ゲノム編集研究のメタデータベース

2022年12月26日

[出典] "GEM: Genome Editing Meta-database, a dataset of genome editing related metadata systematically extracted from PubMed literatures" Suzuki T, Bono H. Gene Genome Ed. 2022-12-22. https://doi.org/10.1016/j.ggedit.2022.100024 [著者所属] 広島大学[Webサ ... もっと読む

CRISPRbase：17生物種54種類の細胞を対象とする1,252,935件の塩基編集結果を統合したデータベースの構築・利用・提供

2022年11月17日

[出典] "Annotation and evaluation of base editing outcomes in multiple cell types using CRISPRbase" Fan J, Shi L, Liu Q [..] Xue L, Sun L, Mao F. Nucleic Acids Res 2022-11-09. https://doi.org/10.1093/nar/gkac967 [著者所属] Peking University Third Hospital ... もっと読む

NCBIとEMBL-EBIが共同でゲノムアノテーションの基準となる情報資源を構築・提供

2022年04月16日

[注] Matched Annotation from NCBI and EMBL-EBI (MANE)の共同プロジェクトで，RefSeqとEnsembl/GENCODEとを統合[出典] "A joint NCBI and EMBL-EBI transcript set for clinical genomics and research" Morales J, Pujar S [..] Murphy T. Nature 2022-04-06. https://doi ... もっと読む

COVIDome: COVIDマルチオミックスデータ・エクスプローラー

2021年07月30日

[出典] "The COVIDome Explorer Researcher Portal" Sullivan KD [..] Espinosa JM. Cell Rep. [Journal Pre-proof] Accepted 2021-07-22. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109527　COVID-19パンデミックは，武漢株のゲノム配列が公開された瞬間から，迅速な共同研究 ... もっと読む

ヒト腸マイクロバイオームに由来する189,960個のDNAウイルスのメタゲノム解析

2021年06月30日

[出典] "Metagenomic compendium of 189,680 DNA viruses from the human gut microbiome" Nayfach S [..] Kyrpides NC. Nat Microbiol. 2021-06-24. https://doi.org/10.1038/s41564-021-00928-6[データ提供サイト] https://portal.nersc.gov/MGV/　バクテリオファージ (以 ... もっと読む