crisp_bio

ブログ名のcrisp_bioは,crispとCRISPRに由来し,CRISPR関連,時折,データベース,マイクロバイオーム,タンパク質,リキッドバイオプシー関連の,主として研究論文の紹介,を続けている.2020年3月からは新型コロナウイルス関連投稿が加わり,まだ収束していない.ブログアイコンはウェルカムトラスト・ゲノムキャンパス内のモニュメントの一つ.菅原秀明 [理研からDDBJ/遺伝研を経てフリー]

タグ:データベース

[注] Matched Annotation from NCBI and EMBL-EBI (MANE)の共同プロジェクトで,RefSeqとEnsembl/GENCODEとを統合[出典] "A joint NCBI and EMBL-EBI transcript set for clinical genomics and research" Morales J, Pujar S [..] Murphy T. Nature 2022-04-06. https://doi ... もっと読む

[出典] "The COVIDome Explorer Researcher Portal" Sullivan KD [..] Espinosa JM. Cell Rep. [Journal Pre-proof] Accepted 2021-07-22. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109527 COVID-19パンデミックは,武漢株のゲノム配列が公開された瞬間から,迅速な共同研究 ... もっと読む

[出典] "Metagenomic compendium of 189,680 DNA viruses from the human gut microbiome" Nayfach S [..] Kyrpides NC. Nat Microbiol. 2021-06-24. https://doi.org/10.1038/s41564-021-00928-6[データ提供サイト] https://portal.nersc.gov/MGV/ バクテリオファージ (以 ... もっと読む

[出典] "The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNA" Lorenz L, Chiu H-S [..] Sumazin P, Mestdagh P. Nat Biotechnol. 2021-06-17. https://doi.org/10.1038/s41587-021-00936-1; NEWS "Our knowledge about the human transcriptome is now assembled in ... もっと読む

診断や治療の標的として有用な因子の探索を容易にする癌細胞依存性の包括的検索を可能とするCancer Dependency Mapの完成に向けたインフラの検証 ... もっと読む

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