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blogging about crisp bio-S&T, especially CRISPR.

タグ:データベース

診断や治療の標的として有用な因子の探索を容易にする癌細胞依存性の包括的検索を可能とするCancer Dependency Mapの完成に向けたインフラの検証 ... もっと読む

 D. S. Goodsellは、RCSB Protein Data Bankの"Molecular of the Month" [1, 2]のページを20年間にわたり継続・更新し続けており、また、PDB-101[3]のメニューの中で一連の分子の精密な色彩画を"Molecular Landcapes by David. S. Goodsell"を展開している。 今回、SARSコ ... もっと読む

[出典] "iCSDB: an integrated database of CRISPR screens" Choi A, Jang I [..] Lee B, Lee S. Nucleic Acids Res. 2020-11-02. 梨花女子大学校とKRIBBを主とする研究グループは、公開されているCRISPR-Cas9スクリーニングのデータ資源が、利便性と更新性を欠いているとし ... もっと読む

[出典] "CRISpy-pop: a web tool for designing CRISPR/Cas9-driven genetic modifications in diverse populations" Stoneman HR [..] Hittinger CT. bioRxiv 2020-06-20. [Preprint][注] CRISpy-popは"a Python-based web application for the design of CRISPR/Cas9 sgRNA ... もっと読む

[出典] "crisprSQL: a novel database platform for CRISPR/Cas off-target cleavage assays" Störtz F, Minary P.  (U Oxford). Nucleic Acids Res. 2020-10-21. crisprSQL (version 10 July 2020)の概要 [Figure 1引用右図参照]154のガイドRNAと25,632の標的配列を登録 ... もっと読む

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