論文・記事紹介：CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野)；タンパク質工学；情報資源・生物資源；新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症；研究公正

2021年06月25日｜

RNA Atlas: ヒト・トランスクリプトームのこれまでになく包括的なアトラスを構築・公開

[出典] "The RNA Atlas expands the catalog of human non-coding RNA" Lorenz L, Chiu H-S [..] Sumazin P, Mestdagh P. Nat Biotechnol. 2021-06-17. https://doi.org/10.1038/s41587-021-00936-1; NEWS "Our knowledge about the human transcriptome is now assembled in …

2019年10月23日｜CRISPR

[20200516更新] シングルセルから細胞系譜と転写プロファイルを同時に読み取れるCRISPR/Cas9マウス系統を樹立

2020-05-16 Cell 論文出版2019-10-23 bioRixv 投稿に準拠した初稿[出典] An engineered CRISPR/Cas9 mouse line for simultaneous readout of lineage histories and gene expression profiles in single cell. Bowling S, Sritharan D [..] Hormoz S, Camargo FD. bioRxiv. …

2018年11月30日｜

新たな近接依存性標識法"Proximity-CLIP"によるRNA-タンパク質結合とRNA局在化の精密解析

[出典] "Proximity-CLIP provides a snapshot of protein-occupied RNA elements in subcellular compartments" Benhalevy D, Anastasakis DG, Hafner M. Nat Methods. 2018-11-26.RNAの細胞内小器官局在を解析する手法として、APEX-RIP (RNA immunoprecipitation)やRaPIDな …

2018年01月31日｜最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ

同一細胞を対象とするmRNAとタンパク質の同時定量の新技術“デジタルPLA”

(構造生命科学ニュースウオッチ2016/03/30から転載)[出典] [技術プレビュー] Yihan Lin & Michael B. Elowitz "Central Dogma Goes Digital" Mol.Cell 2016 Mar 17;61(6):791-792. [技術報告] Cem Albayrak et al. "Digital Quantification of Proteins and mR …

2018年01月16日｜最終更新2022年PDISニュースウオッチ・アーカイブ

NetDecoder: インタラクトームにトランスクリプトームを統合し疾患に特有なサブネットワークと鍵となる遺伝子を同定可能にする情報プラットフォームを開発

(構造生命科学ニュースウオッチ2016/03/22から転載)[出典]Edroaldo Lummertz da Rocha et al. "NetDecoder: a network biology platform that decodes context-specific biological networks and gene activities.." Nucleic Acids Res. Published online 2016 …

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タグ：トランスクリプトーム

RNA Atlas: ヒト・トランスクリプトームのこれまでになく包括的なアトラスを構築・公開

[20200516更新] シングルセルから細胞系譜と転写プロファイルを同時に読み取れるCRISPR/Cas9マウス系統を樹立

新たな近接依存性標識法"Proximity-CLIP"によるRNA-タンパク質結合とRNA局在化の精密解析

同一細胞を対象とするmRNAとタンパク質の同時定量の新技術“デジタルPLA”

NetDecoder: インタラクトームにトランスクリプトームを統合し疾患に特有なサブネットワークと鍵となる遺伝子を同定可能にする情報プラットフォームを開発