[注] FUGAsseM (Function predictor of Uncharacterized Gene products by Assessing high-dimensional community data in Microbiomes)[背景] 微生物タンパク質は、宿主の多様な生物の機能全てに関与している。しかし、ヒト・マイクロバイオームの中で最も深く広く …
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タグ:マイクロバイオーム
地球規模のメタゲノム探索によりCRISPR標的の新たなパターンが明らかに
背景 微生物と、ウイルスやプラスミドなどの可動性遺伝要素(MGE)との相互作用が、マイクロバイオームの構造とプロセスを駆動してきた。近年、CRISPR-Casシステムが、これらの宿主-MGE相互作用の重要な調節因子であることが知られるに至ったが、地球上のバイオーム全体にわ …
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地球規模の海洋微生物多様性と生物探査におけるその可能性
過去20年間、海洋システムから回収された微生物ゲノムの数が著しく増加した。しかし、この海洋ゲノムの多様性をバイオテクノロジーおよび生物医学的応用に応用は、それほどには進んでいない。 BGIResearchを主とする研究チームは今回、NCBI, EBIおよびJGIから2009年8月か …
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[20240412更新] CRISPRメモ_2019/03/14 - 1 (4件)
2024-04-12 第4項は初稿ではbioRxiv 投稿 (preprint) に準拠していたが、ISME Journal:Multidisciplinary Journal of Microbial Ecology 誌から査読済み論文として出版された書誌情報を追記2019-03-14 初稿1. ナノニードル・アレイ (NNA) によりCas9-sgRNA RNPを細胞に直 …
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地球規模のマイクロバイオームに由来する小型のタンパク質の包括的カタログを構築・公開
[出典] "A catalog of small proteins from the global microbiome" Duan Y [..] Zhao X-M, Bork P, Coelho LP. Nat Commun. 2024-08-31. https://doi.org/10.1038/s41467-024-51894-6 [所属] Fudan U, Lingang Laboratory (Shanghai), U Federal de São Carlos – UFSCar …
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