トロント大学のBrenda Andrews教授とCharles Boone教授（兼 理研）ならびにミネソタ大学のChad L. Myers教授を共同責任著者とする総勢90人の共著者が、「ヒト半数体細胞株HAP1において、ゲノムワイドCRISPR-Cas9 KOスクリーンを用いて約400万個の遺伝子ペアに加えた摂動が …
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タグ：分子間相互作用
塩基編集 (CBEとABE) スクリーニングにより, プロテオームワイドで細胞のSLiM依存性マップを作成
SLiM（Short Linear Motif / 短鎖線状モチーフ）は、molecular recognition features (MoRFs)、molecular recognition elements (MREs)、または、eukaryotic linear motifs (ELMs) とも呼ばれ、重要でありながら十分に解明されていないタンパク質相互作用モジュールのクラ …
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dCas9-Suntagをベースとするタンパク質リクルートメントアッセイ法CRISPR-PITAを開発し, KSHVのLANAの一方向性リクルートメントを発見
[注] KSHV (HHV-8; カポジ肉腫関連ヘルペスウイルス); LANA (KSHVの潜伏感染関連核抗原)；CRISPR-PITA (Protein Interaction and Telomere Recruitment Assay) イスラエルのバル＝イラン大学の研究チームが、標題のCRISPR-PITAにより、相互作用するタンパク質の中には、一方 …
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CRISPR-Cas12aをベースとするDNA回路による細胞表面受容体クラスターの非微視的検出
細胞表面におけるタンパク質間相互作用（PPI）は、その臨床的意義の高さから大きな関心を集めているが、これまで細胞表面PPIを検出する方法は主として顕微鏡に依存している。シンガポール国立大学の研究チームが今回標題のように、顕微鏡に依存することなく細胞表面の受容 …
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創薬標的とすべきタンパク質間相互作用の特定を支援するアンサンブル深層学習フレームワークPIONEER
[注] PPI（protein-protein interaction / タンパク質間相互作用）[出典] "A structurally informed human protein–protein interactome reveals proteome-wide perturbations caused by disease mutations" Xiong D, Qiu Y, Zhao J, Zhou Y, Lee D [..] Cheng F, Yu H. Nat …
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