2020-12-15 更新 Split-TurboID [*]を開発しアストロサイトとその神経接着分子の機能解析に至った論文へのリンクを追加: "Chemico-genetic discovery of astrocytic control of inhibition in vivo". Takano T [..] Eroglu C, Soderling SH. Nature 2020-11-11. https://do ...
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タグ：分子間相互作用
CEN-tools: 大規模なゲノムワイドCRISPRスクリーンのデータをベースとして, コンテクストに依存する必須遺伝子と細胞過程の同定を支援する情報資源
[出典] "CEN‐tools: an integrative platform to identify the contexts of essential genes" Sharma S, Dincer C, Weidemüller P, Wright GJ, Petsalaki E. Mol Syst Biol. 2020-10-19. EMBLとWellcome Sanger Instituteの研究チームが今回、Context‐specific Essenti ...
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BioGRIDデータベース: 高品質な (curated)タンパク質, 遺伝子および化合物の間の相互作用を網羅した生物医学情報資源
[出典] "The BioGRID database: A comprehensive biomedical resource of curated protein, genetic and chemical interactions" Oughtred R, Rust J, Chang C [..] Dolinski K, Tyers M. Protein Sci. 2020-10-18.[注] BioGRID=Biological General Repository for Interacti ...
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CAPID: 近接依存性標識法にdCasRxを組み込み、lncRNAへの結合タンパク質を同定
[出典] "CRISPR-assisted detection of RNA–protein interactions in living cells" Yi W, Li J, Zhu X, Wan X [..] Chan KM, Zhang L, Yan J. Nat Methods 2020-06-22. [crisp_bio] CAPIDはCRISPR-assisted RNA–protein interaction detection methodに由来する 近年 ...
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RNA-RNAの相互作用をヒト細胞内で同定可能とするRIC-seqの開発と検証
[出典] "RIC-seq for global in situ profiling of RNA–RNA spatial interactions" Cai Z, Cao C, Ji L [..] Xue Y. Nature 2020-05-06. 二次／三次構造をとるRNA分子は分子間相互作用に加えて、多様なRNA結合タンパク質 (RBP)とも相互作用することで、生物にとって重要 ...
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