PROPER-seq: protein-protein interaction sequencing[出典] "Revealing protein-protein interactions at the transcriptome scale by sequencing" Johnson KL, Qi Z [..] Zhong S. Mol Cell. 2021-08-03. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2021.07.006 UCSDを主とする研 …
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タグ:分子間相互作用
[20210611更新] 新たな近接依存性標識法"TurboID"によるPPI解析 + Split-TurboID
2020-06-11 TurboIDとsplit-TurboIDによる哺乳類細胞の近接標識法のプロトコル論文情報を追記"Proximity labeling in mammalian cells with TurboID and split-TurboID" Cho KF, Branon TC, Udeshi ND, Myers SA, Carr SA, Ting AY. Nat Proc. 2020-11-02. https://doi.org/1 …
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機能不明の遺伝子の機能同定を可能とするco-essentialモジュールのゲノムワイド・アトラス構築
[出典] "A genome-wide atlas of co-essential modules assigns function to uncharacterized genes" Wainberg M, Kamber RA, Balsubramani A [..] Bassik MC, Kundaje A. (bioRxiv 2019-11-01). Nat Genet. 2021-04-15. https://doi.org/10.1038/s41588-021-00840-z Stanf …
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CEN-tools: 大規模なゲノムワイドCRISPRスクリーンのデータをベースとして, コンテクストに依存する必須遺伝子と細胞過程の同定を支援する情報資源
[出典] "CEN‐tools: an integrative platform to identify the contexts of essential genes" Sharma S, Dincer C, Weidemüller P, Wright GJ, Petsalaki E. Mol Syst Biol. 2020-10-19. EMBLとWellcome Sanger Instituteの研究チームが今回、Context‐specific Essenti …
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BioGRIDデータベース: 高品質な (curated)タンパク質, 遺伝子および化合物の間の相互作用を網羅した生物医学情報資源
[出典] "The BioGRID database: A comprehensive biomedical resource of curated protein, genetic and chemical interactions" Oughtred R, Rust J, Chang C [..] Dolinski K, Tyers M. Protein Sci. 2020-10-18.[注] BioGRID=Biological General Repository for Interacti …
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