ブログ名のcrisp_bioは，crispとCRISPRに由来し，CRISPR技術の開発と応用について多数投稿し，時折，データベース，マイクロバイオーム，タンパク質，リキッドバイオプシーなどの観点から投稿するに至った．2020年3月からはそれに，SARS-CoV-2/COVID-19に関する投稿が加わり，まだ収束していない．ブログアイコンはサンガー研究所やEMBL-EBIがある英国ウェルカムトラスト・ゲノムキャンパス内のモニュメントの一つ．菅原秀明 (理研 -> DDBJ/遺伝研 -> アマチュア)

2022年期待の臨床試験イレブン

2021年12月26日

Naure Medicine誌が第一線の研究者から，CRISPR医療やサイケデリック療法から腫瘍溶解性ウイルスまで，2022年期待の臨床試験11例について聴き取った．[出典] "11 clinical trials that will shape medicine in 2022" Arnold C. Nat Med. 2021-12-10; Table 1 Clinical t ... もっと読む

110億を超えるバーチャル化合物ライブリーからリガンドを効率よく特定可能とするアルゴリズムV-SYNTHES

2021年12月21日

[注] V-SYNTHES: virtual synthon hierarchical enumeration screening[出典] "Synthon-based ligand discovery in virtual libraries of over 11 billion compounds" Sadybekov AA, Sadybekov AV, Liu Y [..] Roth BL, Makriyannis A, Katritch V. Nature 2021-12-15. https ... もっと読む

[20210923更新] Excision BioTherapeutics社のSaCas9をベースとするHIV-1治療薬候補 EBT-101 のIND申請をFDA承認

2021年09月23日

2021-09-23 参考資料を追加2021-09-19 初稿[出典] NEWS "FDA Approves First Human Trial for Potential CRISPR-Led HIV Cure" BioSphere. 2021-09-16. https://www.biospace.com/article/breakthrough-human-trial-for-crispr-led-hiv-cure-set-for-early-2022/　EBT-101はC ... もっと読む

[展望] PROTACで標的可能なゲノム

2021年07月22日

PROTACs = Proteolysis-targeting chimeras[出典] REVIEW "The PROTACtable genome" Schneider M [..] Leach AR. Nat Rev Drug Discov. 2021-07-20. https://doi.org/10.1038/s41573-021-00245-x　著者所属はEMBL-EBIを主として，Wellcome Sanger Institute, Integrated Drug ... もっと読む

標的タンパク質分解をベースとする創薬に有用なデータベースを構築 - 212種類のキナーゼが対象

2020年12月28日

[出典] "Mapping the Degradable Kinome Provides a Resource for Expedited Degrader Development" Donovan KA, Ferguson FM [..] Sim T, Gray NS, Fischer ES. Cell 2020-12-03. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.10.038　変異タンパク質を標的とする創薬の戦略として ... もっと読む