CRISPR-Cas12aシステムは、そのcrRNAに相補的な標的二本鎖DNA (dsDNA) をシス切断する活性に加えて、標的dsDNAをアクチベーターとして発揮される一本鎖DNA (ssDNA)を非特異的にトランス切断する活性 (コラテラル活性) も備えている。この特性から、Cas12a-crRNAは、ゲノム …
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タグ：合成生物学
タンパク質間やRNAとタンパク質の近接に応じて活性化するゲノム編集ツール"P3 editing"の開発と応用
[注] P3 (protein-protein proximity) 合成生物学の目標のひとつは、プログラム可能な入出力を持つ任意の分子回路の設計を可能にすることである。このような回路は、電子回路と天然の回路を橋渡しすることで、生きた細胞内で予測可能な方法で情報を処理することを可能にする …
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MultiCRISPR-EGA：エリート選択遺伝的アルゴリズムを用いた多重CRISPRのためのガイドRNAアレイ設計の最適化
[注] EGA：エリート選択アルゴリズムEGA (Elitist Genetic Algorithm ) ；グラフィカルアブストラクト参照 複数のゲノム部位を同時に効率よく編集できる多重化CRISPRシステムは、複雑な遺伝子改変のための強力なツールである。しかし、効果的な多重化ガイドRNA（gRNA）ア …
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![[総説] 微生物を対象とする強力な塩基編集ツールボックス：最適化戦略から幅広い応用展開まで](https://livedoor.blogimg.jp/crisp_bio/imgs/e/b/ebee512e-s.png)
[総説] 微生物を対象とする強力な塩基編集ツールボックス：最適化戦略から幅広い応用展開まで
CRISPR-Casヌクレアーゼ遺伝子編集技術から派生した塩基エディター（base editor: BE）は、生命科学のフロンティアを牽引し続ける実用的な遺伝子編集ツールとして発展を続けている。BEは、Casヌクレアーゼと異なり、二本鎖DNAを切断することなく、標的部位に点突然変異を効 …
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微生物工学に向けて, 汎用的で忠実度の高いシトシン塩基エディター (CBE) を開発
触媒活性を不活性化あるいは低減したCasヌクレアーゼに基づく塩基エディター（BE）は、Casヌクレアーゼと異なり、DNA2本鎖を切断することなく、1塩基編集を可能にした。BEは微生物の遺伝子工学にも多様な編集オプションを提供するが、その応用には、プロトスペーサー隣接モ …
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