crisp_bio

ブログ名のcrisp_bioは,crispとCRISPRに由来し,CRISPR技術の開発と応用について多数投稿し,時折,データベース,マイクロバイオーム,タンパク質,リキッドバイオプシーなどの観点から投稿するに至った.2020年3月からはそれに,SARS-CoV-2/COVID-19に関する投稿が加わり,まだ収束していない.ブログアイコンはサンガー研究所やEMBL-EBIがある英国ウェルカムトラスト・ゲノムキャンパス内のモニュメントの一つ.菅原秀明 (理研 -> DDBJ/遺伝研 -> アマチュア)

タグ:合成致死

[注] PSTK (phosphoseryl-tRNA kinase/ホスホセリルtRNAキナーゼ ); HCC (Hepatocellular carcinoma/肝細胞がん)[出典] "CRISPR screens uncover protective effect of PSTK as a regulator of chemotherapy-induced ferroptosis in hepatocellular carcinoma" Chen Y, Li L, ... もっと読む

[注] 合成致死 (Synthetic Lethal): 2つの遺伝子の機能的欠損が重なると細胞死に至り,どちらか一方の遺伝子の機能的欠損では細胞死に至らない遺伝子間相互作用[出典] "VRK1 is a Paralog Synthetic Lethal Target in VRK2-methylated Glioblastoma" Shields JA [..] Emmanue ... もっと読む

出典] "Genome-wide CRISPR-cas9 knockout screening identifies GRB7 as a driver for MEK inhibitor resistance in KRAS mutant colon cancer" You C, Lou D, You J [..] Jing J, Shi H. Oncogene. 2021-10-30. https://doi.org/10.1038/s41388-021-02077-w State Key Lab ... もっと読む

[注] 合成致死相互作用 [synthetic lethal interactions, SLI][出典] PROTOCOL "Identification of Synthetic Lethal Interactions Using High-Throughput, Arrayed CRISPR/Cas9-Based Platforms" MacAuley MJ, Abuhussein O, Vizeacoumar FS. In: Vizeacoumar FJ, Freywald ... もっと読む

[出典] "Paralogous synthetic lethality underlies genetic dependencies of the cancer-mutated gene STAG2" Bailey ML [..] Hieter P. Life Sci Alliance 2021-08-30.https://doi.org/10.26508/lsa.202101083 University of British ColumbiaとUniversity of Torontoの研 ... もっと読む

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