RNAの3次元構造を予測することは、生体高分子の構造予測の進歩が続いているにもかかわらず、依然として課題である。タンパク質の構造予測を革新したAlphaFoldも、RNA構造予測への展開は遅れていた。その中で、AlphaFoldの最新リリースであるAlphaFold3は、DNA、リガンド、R …
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タグ：構造予測
手つかずの南極の土壌に存在する新たな適応免疫系
[出典] "Novel adaptive immune systems in pristine Antarctic soils" Van Goethem MW [..] Makhalanyane TP. Sci Rep. 2025-01-18. https://doi.org/10.1038/s41598-024-83942-y [著者所属(記事文末)] 南極環境は、氷点下、高い紫外線照射レベル、極度な低湿度、極度な栄 …
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AlphaFold2とESMFoldで予測したタンパク質構造を利用して, フラビウイルス科の複雑な進化過程を捉えた
[出典] 論文 "Mapping glycoprotein structure reveals Flaviviridae evolutionary history" Mifsud JCO [..] Grove J. Nature 2024-09-04. https://doi.org/10.1038/s41586-024-07899-8 [所属] U Sydney, MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research, 東大医科 …
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RoseTTAFoldからRoseTTAFoldNAへ：DNA/RNA結合タンパク質の構造予測へと展開
[出典] 論文 "Accurate prediction of protein–nucleic acid complexes using RoseTTAFoldNA" Baek M, McHugh R, Anishchenko I, Jiang H, Baker D, DiMaio F. Nat Methods 2023-11-23. https://doi.org/10.1038/s41592-023-02086-5 [著者所属] Seoul National U, U Washin …
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マイクロバイオーム (バクテリアとアーケア)に隠されている機能性ダークマターに光を照らす
- 既知の一連のタンパク質ファミリーに匹敵する規模の新規ファミリーを発見[出典] 論文 "Unraveling the functional dark matter through global metagenomics" Pavlopoulos GA [..] Kyrpides NC; Novel Metagenome Protein Families Consortium. Nature 2023-10-11. ht …
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