論文・記事紹介：CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野)；タンパク質工学；情報資源・生物資源；新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症；研究公正

2024年04月01日｜

AlphaFold2を利用して, 関心のあるタンパク質がとるコンフォメーション・ランドスケープを予測する

[出典] "High-throughput prediction of protein conformational distributions with subsampled AlphaFold2" Da Silva GM, Cui JY, Dalgarno DC, Lisi GP, Rubenstein BM. Nat Commun. 2024-03-27. https://doi.org/10.1038/s41467-024-46715-9 [所属] Brown U, Dalgarno Sc …

2024年02月03日｜

[論説] 構造生物学を共に前に進めよう

- Cell 誌を含むCell Press出版ジャーナルにおける構造生物学特集号の解説[出典] EDITORIAL "Moving structural biology forward together" The Cell Editorial Team. Cell 2024-02-01. https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.01.006　構造生物学の分野は過去数十年の間に …

2023年12月12日｜

AlphaFold予測は、高精度なPDB構造と不整合な例も多々あるが、仮説生成のベースとして極めて有用であり、進化を続けていくだろう

[出典] "AlphaFold predictions are valuable hypotheses and accelerate but do not replace experimental structure determination" TerwilligerTC, Liebschner D, Croll TI. et al. Nat Methods. 2023-11-30. https://doi.org/10.1038/s41592-023-02087-4 [著者所属] New …

2023年11月21日｜

[レビュー] タンパク質の天然変性領域が細胞機能を担う分子基盤

[出典] Review "The molecular basis for cellular function of intrinsically disordered protein regions" Holehouse AS, Kragelund B. Nat Rev Mol Cell Biol 2023-11-13. https://doi.org/10.1038/s41580-023-00673-0 [著者所属] Washington U School of Medicine, U Cop …

2023年06月03日｜

AlphaFold2の限界を、実験で決定した距離制約によって、突破する

[出典] "Protein structure prediction with in-cell photo-crosslinking mass spectrometry and deep learning" Stahl K, Graziadei A, Dau T, Brock O, Rappsilber J. Nat Biotechnol. 2023-03-20. https://doi.org/10.1038/s41587-023-01704-z [著者所属] Technische Uni …

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タグ：構造生物学

AlphaFold2を利用して, 関心のあるタンパク質がとるコンフォメーション・ランドスケープを予測する

[論説] 構造生物学を共に前に進めよう

AlphaFold予測は、高精度なPDB構造と不整合な例も多々あるが、仮説生成のベースとして極めて有用であり、進化を続けていくだろう

[レビュー] タンパク質の天然変性領域が細胞機能を担う分子基盤

AlphaFold2の限界を、実験で決定した距離制約によって、突破する