CROTON = CRISPR Outcomes Through cONvolutional neural networks[出典] "CROTON: an automated and variant-aware deep learning framework for predicting CRISPR/Cas9 editing outcomes" Li VR, Zhang Z, Troyanskaya OG. Bioinformatics 2021-07-12. https://doi.org/10 ...
もっと読む
タグ：機械学習-AI
Cas12aのgRNA設計支援: 深層学習に説明可能性を加え，k-merルールへのマッピングを実現
CRISPR-VAE: CRISPR-Variational Autoencoder[出典] "CRISPR-VAE: A Method for Explaining CRISPR/Cas12a Predictions, and an Efficiency-aware gRNA Sequence Generator" Obeid AS, Marzouqi HA [Khalifa University (Abu Dhabi)]. bioRxiv. 2021-07-06 [プレプリント]. h ...
もっと読む
Attention機構を組み入れた深層学習によるsgRNAのオンターゲットとオフターゲット活性予測
[出典] "Prediction of CRISPR/Cas9 single guide RNA cleavage efficiency and specificity by attention-based convolutional neural networks" Zhang G, Zeng T, Dai Z, Dai X. Comput Struct Biotechnol J. 2021-03-07. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.03.001 中 ...
もっと読む
C-SVR CRISPR-Cas: 深層学習モデルによるCRISPR/Cas12a gRNAの活性予測
[出典] "C-SVR Crispr: Prediction of CRISPR/Cas12 guideRNA activity using deep learning models" Sa'idAmeen Z, Ozsoz M, Mubarak AS, Turjman FA, Serte S. Alex Eng J 2021-02-27. https://doi.org/10.1016/j.aej.2021.02.007 Near East University (Cyprus)の研究チ ...
もっと読む
[20210301更新] GoogleのCOVID-19感染予測 (日本版)を見て思うこと (1)
[注] 2021-03-01以後「(2) https://crisp-bio.blog.jp/archives/25729908.html」に続く2021-03-01 10:40 27日版の東京都と大阪府の日別陽性者数の予測グラフは、25日版とほぼ同じ傾向を示した。 ところで、NHKの解析[*]によると、2月27日(土)の首都圏5ヶ所での人出が、直近 ...
もっと読む
