[注] タンパク質の構造を原子レベルの精度で予測するDeepMindのAlphaFoldとBakerグループのRoseTTAFold 2021-10-20 更新 AlphaFoldが，何気に利用されるようになってきたようだ：2021-10-20 [REVIEW] タイプIII CRISPR-Casシステム: 最も複雑な原核生物の免疫システムを ...
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タグ：機械学習-AI
ハイスループットな遺伝子必須性スクリーニング結果をベースとして，Cas13d (CasRx)ガイドRNAの活性の深層学習モデルを構築
RNAの活性の深層学習モデルを構築[出典] "Deep learning of Cas13 guide activity from high throughput gene essentiality screening"Wei J [..] Hsu PD, Konermann S. bioRixv. 2021-09-14 [プレプリント]. https://doi.org/10.1101/2021.09.14.460134 Salk InstituteでRN ...
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DeepCas13: 機械学習によるCRISPR-Cas13dのオンターゲットとオフターゲットの活性のモデリング
[出典] "Modeling CRISPR-Cas13d on-target and off-target effects using machine learning approaches" Cheng X, Li Z [..] Fei T, Li W. bioRxiv. 2021-09-04 [プレプリント]. https://doi.org/10.1101/2021.09.02.458773 Children’s National Hospital, George Washing ...
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[20210828更新] CBEとABEの結果予測システム: 数千のターゲットライブラリーでの実験データをベースとしてアテンション技術を組み入れた深層学習で実現
2021-08-28 Nature Communications誌掲載論文の書誌情報を追記し，テキストの一部を更新．"Predicting base editing outcomes with an attention-based deep learning algorithm trained on high-throughput target library screens" Marquart KF. Allam A, Janjuha S [..] K ...
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深層学習を利用して，細胞核に治療用アンチセンス・オリゴマーを効率よく送達する人工ミニタンパク質 (miniproteins)を設計
MITとSarepta Therapeuticsの研究グループからの論文．[出典] "Deep learning to design nuclear-targeting abiotic miniproteins" Schissel CK [..] Gómez-Bombarelli R, Pentelute BL. Nat Chem. 2021-08-09. https://doi.org/10.1038/s41557-021-00766-3; Machine learni ...
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