crisp_bio

crisp_bioはCRISPRのオーラを浴びる中で思いついたブログ名でしたが,2021年からは専ら,CRISPR技術の開発と応用ならびにSRAS-CoV-2/COVID-19に関する投稿になってしまいました.データベース,生物資源センター,マイクロバイオーム,タンパク質デザインを取り上げたいと思いつつ.

タグ:機械学習-AI

[注] タンパク質の構造を原子レベルの精度で予測するDeepMindのAlphaFoldとBakerグループのRoseTTAFold 2021-10-20 更新  AlphaFoldが,何気に利用されるようになってきたようだ:2021-10-20 [REVIEW] タイプIII CRISPR-Casシステム: 最も複雑な原核生物の免疫システムを ... もっと読む

RNAの活性の深層学習モデルを構築[出典] "Deep learning of Cas13 guide activity from high throughput gene essentiality screening"Wei J [..] Hsu PD, Konermann S. bioRixv. 2021-09-14 [プレプリント]. https://doi.org/10.1101/2021.09.14.460134 Salk InstituteでRN ... もっと読む

[出典] "Modeling CRISPR-Cas13d on-target and off-target effects using machine learning approaches" Cheng X, Li Z [..] Fei T, Li W. bioRxiv. 2021-09-04 [プレプリント]. https://doi.org/10.1101/2021.09.02.458773 Children’s National Hospital, George Washing ... もっと読む

2021-08-28 Nature Communications誌掲載論文の書誌情報を追記し,テキストの一部を更新."Predicting base editing outcomes with an attention-based deep learning algorithm trained on high-throughput target library screens" Marquart KF. Allam A, Janjuha S [..] K ... もっと読む

MITとSarepta Therapeuticsの研究グループからの論文.[出典] "Deep learning to design nuclear-targeting abiotic miniproteins" Schissel CK [..] Gómez-Bombarelli R, Pentelute BL. Nat Chem. 2021-08-09. https://doi.org/10.1038/s41557-021-00766-3; Machine learni ... もっと読む

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