crisp_bio

crisp_bioはCRISPRのオーラも念頭においた命名でしたが,2021年からは専ら,CRISPR技術の開発と応用ならびにSRAS-CoV-2/COVID-19に関する投稿になってしまいました.データベース,生物資源センター,マイクロバイオーム,タンパク質デザインを取り上げたいと思いつつ.

タグ:機械学習-AI

CROTON = CRISPR Outcomes Through cONvolutional neural networks[出典] "CROTON: an automated and variant-aware deep learning framework for predicting CRISPR/Cas9 editing outcomes" Li VR, Zhang Z, Troyanskaya OG. Bioinformatics 2021-07-12. https://doi.org/10 ... もっと読む

CRISPR-VAE: CRISPR-Variational Autoencoder[出典] "CRISPR-VAE: A Method for Explaining CRISPR/Cas12a Predictions, and an Efficiency-aware gRNA Sequence Generator" Obeid AS, Marzouqi HA [Khalifa University (Abu Dhabi)]. bioRxiv. 2021-07-06 [プレプリント]. h ... もっと読む

[出典] "Prediction of CRISPR/Cas9 single guide RNA cleavage efficiency and specificity by attention-based convolutional neural networks" Zhang G, Zeng T, Dai Z, Dai X. Comput Struct Biotechnol J. 2021-03-07. https://doi.org/10.1016/j.csbj.2021.03.001 中 ... もっと読む

[出典] "C-SVR Crispr: Prediction of CRISPR/Cas12 guideRNA activity using deep learning models" Sa'idAmeen Z, Ozsoz M, Mubarak AS, Turjman FA, Serte S. Alex Eng J 2021-02-27. https://doi.org/10.1016/j.aej.2021.02.007 Near East University (Cyprus)の研究チ ... もっと読む

[注] 2021-03-01以後「(2) https://crisp-bio.blog.jp/archives/25729908.html」に続く2021-03-01 10:40 27日版の東京都と大阪府の日別陽性者数の予測グラフは、25日版とほぼ同じ傾向を示した。 ところで、NHKの解析[*]によると、2月27日(土)の首都圏5ヶ所での人出が、直近 ... もっと読む

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