Cancer Dependency Map（DepMap）は、2017年にCell 誌へ掲載された論文 “Defining a Cancer Dependency Map” [＃1] をきっかけに広まった概念・プロジェクトです。米国のブロード研究所が主導した「DepMap Consortium（DMC）」の発足 [＃2] などを通じて用語として定着し、 …
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タグ：研究資源
ヒトiPS細胞を対象とするゲノムスケールのCRISPRi Perturb-seqアトラス登場
カリフォルニア大学サンディエゴ校（UCSD）の7月13日付のニュースで、Nature Biotechnology 誌から2026年7月1日に出版された論文「A genome-scale CRISPRi perturbation atlas of human induced pluripotent stem cells」が紹介されています。この論文についは bioRxivプレプ …
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理化学研究所, 遺伝子組換えに利用される様々な外来遺伝子を標的とする汎用的かつ効率的なスクリーニング法を発表
理研の研究チームは、シロイヌナズナをモデルとして、15種類の遺伝子とコントロール用内在遺伝子3種類を検出可能とする２種類のPCR法、fDET法とDET法を開発し、Plant & Cell Physiology 誌から発表しました。対象遺伝子は、薬剤耐性遺伝子, レポーター遺伝子, プロモータ …
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CRISPRスクリーニング技術のリーダーDoench博士がPerturb-seqの取説のプレプリントを投稿しました - Perturb-seqを用いたCRISPR KOとCRISPRi直接比較
John G Doench博士 ここでは、MIT・ハーバード大学ブロード研究所にて、その名も「Genetic Perturbation Platform（遺伝的遺伝的摂動プラットフォーム）」の研究開発ディレクターを務めているJohn G Doench博士が責任著者となっているbioRxivプレプリントを取り上げます。 …
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iSCORE-PD：パーキンソン病研究のためのアイソジェニック幹細胞コレクション
[注] iSCORE-PD：Isogenic Stem Cell Collection to Research Parkinson’s Disease ゲノム編集を施したヒト多能性幹細胞（hPSC）は、パーキンソン病（PD）のような複雑な疾患を研究するための強力なプラットフォームとなります。2026年6月11日に Nature Communications …
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