MIT発のスピンアウト企業Cache DNAは、生体分子を室温で保存できる技術を開発し、サンプルの保管と輸送のコストを削減し、また信頼性を高めている。 これまで、生命科学、医学、バイオテクニロジー(以下、バイオの世界)はフリーザーに依存してきた。多くの患者サンプル …
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タグ:研究資源
細胞ペインティング画像データベース構築と, ヒト細胞における遺伝子の低発現および過剰発現の形態学的マッピング
細胞ペインティング(cell painting)画像は細胞の状態に関する貴重な知見を提供し、多くの生物学的応用を可能にするが、公開されているアレイデータセットには、摂動を加えられた遺伝子が数百個しか含まれていない。 JUMP 細胞ペインティング コンソーシアム(JUMPーCell …
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新・遺伝子摂動データ統合プラットフォーム "Perturbation Catalogue"
Perturbation Catalogueは、EMBL-EBIがウェルカム・サンガー研究所とヒューマン・テクノポール(Human Technopole)が共同で進めているOpen Targetsプロジェクトの成果である。 遺伝子スクリーニング技術の進歩に伴い、生成されるデータセットの数は急速に増加しているが、 …
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1994年から2年ごとに継続されてきたCASP(タンパク質構造予測コンテスト), 存続の危機
[注] CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction):ウィキペディア タンパク質構造予測精密評価;ウエッブサイト https://www.predictioncenter.org/index.cgi CASPへの米国NIHからの資金援助が枯渇し、助成金を監督するUC Davis(カリフォルニア大学デー …
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[展望] 地球上の微生物資源を次世代のために守る「微生物叢恒久保存イニシアティブ」
7月4日は「マイクロバイオームの日 / "World Microbiome Day"」であった [Webサイト画面キャプチャを右図に引用]。おりしも、6月27日にNature Communcaions誌から標題の"The microbiota vault initiative"の構想が発表されていた。 微生物はヒトにとって味方であり敵であ …
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