[出典] "iCSDB: an integrated database of CRISPR screens" Choi A, Jang I [..] Lee B, Lee S. Nucleic Acids Res. 2020-11-02. 梨花女子大学校とKRIBBを主とする研究グループは、公開されているCRISPR-Cas9スクリーニングのデータ資源が、利便性と更新性を欠いているとし …
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タグ：研究資源
CRISpy-pop: 種内の菌株・系統を意識したsgRNA設計を支援するデータベース
[出典] "CRISpy-pop: a web tool for designing CRISPR/Cas9-driven genetic modifications in diverse populations" Stoneman HR [..] Hittinger CT. bioRxiv 2020-06-20. [Preprint][注] CRISpy-popは"a Python-based web application for the design of CRISPR/Cas9 sgRNA …
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crisprSQL: CRISPR/Casオフターゲット切断アッセイの結果を集約したデータベース
[出典] "crisprSQL: a novel database platform for CRISPR/Cas off-target cleavage assays" Störtz F, Minary P. (U Oxford). Nucleic Acids Res. 2020-10-21. crisprSQL (version 10 July 2020)の概要 [Figure 1引用右図参照]154のガイドRNAと25,632の標的配列を登録 …
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CEN-tools: 大規模なゲノムワイドCRISPRスクリーンのデータをベースとして, コンテクストに依存する必須遺伝子と細胞過程の同定を支援する情報資源
[出典] "CEN‐tools: an integrative platform to identify the contexts of essential genes" Sharma S, Dincer C, Weidemüller P, Wright GJ, Petsalaki E. Mol Syst Biol. 2020-10-19. EMBLとWellcome Sanger Instituteの研究チームが今回、Context‐specific Essenti …
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BioGRIDデータベース: 高品質な (curated)タンパク質, 遺伝子および化合物の間の相互作用を網羅した生物医学情報資源
[出典] "The BioGRID database: A comprehensive biomedical resource of curated protein, genetic and chemical interactions" Oughtred R, Rust J, Chang C [..] Dolinski K, Tyers M. Protein Sci. 2020-10-18.[注] BioGRID=Biological General Repository for Interacti …
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