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科学分野の比較的新しい論文と記事を記録しておくサイト： 主に、CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム編集, エピゲノム編集, 遺伝子治療, 分子診断/代謝工学, 合成生物学/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野) の観点から選択し、時折、タンパク質工学、情報資源・生物資源、新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症、機械学習・AIや研究公正からも選択

タグ：蛋白質工学

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　タンパク質構造は配列を超えて保存されているため、遠縁のタンパク質を解析するには多重構造アライメント（MSTA）が不可欠である。近年、深層学習や大規模言語モデル（LLM）により利用可能なタンパク質構造のレポジトリーが大幅に拡充された（AlphaFold DB や ESMAtlas） …
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｜CRISPR

[*] CAST (CRISPR-associated transposon / CRISPR関連トランスポゾン)　バキュロウイルスは、巨大な二本鎖DNA昆虫ウイルス（≈134 kb）であり、昆虫細胞における異種多タンパク質複合体の高レベル発現 やワクチン産生に広く利用されている。バキュロウイルスはまた、HEK293 …
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　CRISPR-Casシステム、特にCas9は、その誕生以来、ライフサイエンス分野への応用において計り知れない可能性を示してきた。しかし、さらなるCas9ツールキットの拡張は、配列アライメントに基づくマイニングと最適化戦略によって制約されている。中国農業科学院の動物科学研 …
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2026-02-04 Nature Biotechnology 誌刊行論文としての書誌情報へと改訂し、ブログ記事タイトルも改訂　[(旧)膨大な進化データを介した深層学習によるCRISPR-CasのPAM工学 -->(新) CRISPR-Casの制約要件PAMをタンパク質言語モデルでカスタマイズする"Protein2PAM"登場]2025-01 …
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　CRISPR-Casシステムはゲノム編集や病原体検出に革命をもたらしたが、その活性を目的に応じて然るべく制御する技術が求められている。その中で、CRISPR-Cas活性を制御するファージ由来の阻害剤である天然の抗CRISPRタンパク質（Acrs）が注目を集めている。しかしながら、2つ …
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