深層学習を活用したAlphaFoldによって、2億を超えるタンパク質の構造が予測され、公開されている。今回、2つの互いに独立な国際共同研究チームが、AlphaFoldタンパク質構造データベース (AlphaFold Protein Structure Database: AFDB) から公開されているモデルの中で、既 ...
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タグ：蛋白質工学
[20230818更新] 構造予測ネットワークと拡散生成モデルを統合することで、汎用性が高く精密なタンパク質設計を実現
2023-08-18 引用文献2の概要を追記2023-08-17 Research Highlight 記事の書誌情報と概要を追記："Diffusion model expands RoseTTAFold's power" Fudge JB. Nat Biotechnol. 2023-08-11. David Bakerらは、画像解析で成功を収めてきた拡散モデルを、RoseTTAFold法に加え ...
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細胞内の"unfolded protein responses"を偏りなくマッピング可能とするSPOTLITESを開発
[注] SPOTLITES (Scalable POoled Targeting)[出典] "Pooled tagging and hydrophobic targeting of endogenous proteins for unbiased mapping of unfolded protein responses" Sansbury SE, Serebrenik YV [..] Shalem O. bioRxiv 2023-07-14 [preprint]. https://doi.org ...
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CRISPR/Cas9による効率的親和性標識を介してヒト細胞内在性タンパク質のクライオ電顕による構造解析の限界を広げる
[出典] "Efficient tagging of endogenous proteins in human cell lines for structural studies by single-particle cryo-EM" Choi W, Wu H, Yserentant K, Huang B, Cheng Y. PNAS 2023-07-24. https://doi.org/10.1073/pnas.2302471120 [著者所属] UCSF, Chan Zuckerberg ...
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大規模液滴マイクロ流体CRISPRスクリーニング結果をベースに酵母のアミラーゼ分泌向上を実現
[出典] "Large scale microfluidic CRISPR screening for increased amylase secretion in yeast" Johansson SA [..] Steinmetz LM. Lab Chip 2023-07-24. https://doi.org/10.1039/D3LC00111C [著者所属] EMBL, Lesaffre Institute of Science & Technology, Stanford U Sch ...
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